Cilier (af Lat. cilium, egentl. ögonhår), anat., vissa egendomliga hår eller hårliknande bildningar, som träffas hos djur och växter. -- I djuranatomien har detta namn gifvits åt: 1) de korta, styfva, tillspetsade, vanligen mörka ögonhåren, som finnas i flerdubbla rader långs ögonlockens kanter och hvilka på det öfre ögonlocket äro böjda uppåt, på det nedre nedåt; 2) vissa hårlika, ytterligt fina utväxter från celler eller från kroppsytan, hvilka kallas vibratila cilier eller flimmerhår, derför att de hos lefvande kroppar ständigt äro i liflig rörelse, antingen gyratorisk eller spiralformig eller lik den rörelse, som förekommer hos böljande gräs. Af de på celler sittande cilierna finnas antingen en på hvarje cell (t. ex. på spermatozoider) eller flere på hvarje, såsom på de celler, hvilka i större sträckor sammankomma och bilda flimmerepitel. Utbredda på kroppsytan träffas cilierna hos många infusorier, och då än likformiga öfver hela ytan, än gröfre på vissa ställen, t. ex. vid digestionsöppningarna. Hvarken när de finnas på cell eller när de förekomma på kroppsytan äro de blotta bihang till den botten, på hvilken de sitta, utan verkliga utväxter ur denna. Deras rörelse synes vara oberoende af retning på och från nervsystemet, när sådant finnes. G. v. D.
I växtanatomien nyttjas ordet cilier i betydelsen flimmerhår, d. v. s. hårformiga, ytterst fina, endast med tillhjelp af stark mikroskopisk förstoring synbara utskott från protoplasman hos en del (vanligen nakna) celler. Dessa ciliers uppgift är att vara ställflyttningsorgan, och ciliebärande växtceller ega alltid förmåga af ställflyttning. De allra flesta ciliebärande växtceller äro fortplantningsceller, antingen så, att de hvar för sig kunna gro och gifva upphof åt nya individer -- de benämnas då zoosporer eller svärmsporer -- eller så, att två och två eller någon gång flere förena sig med hvarandra och derefter gro -- de kallas då gameter --, eller slutligen så, att de tjenstgöra som befruktande celler, hanceller -- de benämnas då anterozoider eller spermatozoider. (Jfr Befruktning, fig. 1--4 och 7--10.) Cilier hos näringsceller förekomma hos de alger, som tillhöra grupperna Volvocineae och Tetrasporeae. Cellerna äro der ej nakna, utan cilierna skjuta ut genom små öppningar på cellväggen. V. W.